Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms