Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
THOP1P52888 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
THOP1P52888 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
THOP1P52888 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
THOP1P52888 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
THOP1P52888 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
THOP1P52888 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
THOP1P52888 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
THOP1P52888 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
THOP1P52888 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
THOP1P52888 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
THOP1P52888 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
THOP1P52888 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
THOP1P52888 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
THOP1P52888 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
THOP1P52888 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
THOP1P52888 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
THOP1P52888 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
THOP1P52888 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
THOP1P52888 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
THOP1P52888 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
THOP1P52888 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
THOP1P52888 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
THOP1P52888 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
THOP1P52888 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
THOP1P52888 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
THOP1P52888 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
THOP1P52888 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
THOP1P52888 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
THOP1P52888 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
THOP1P52888 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
THOP1P52888 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
THOP1P52888 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
THOP1P52888 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
THOP1P52888 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
THOP1P52888 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
THOP1P52888 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
THOP1P52888 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
THOP1P52888 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
THOP1P52888 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
THOP1P52888 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
THOP1P52888 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
THOP1P52888 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
THOP1P52888 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
THOP1P52888 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
THOP1P52888 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
THOP1P52888 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
THOP1P52888 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
THOP1P52888 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
THOP1P52888 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
THOP1P52888 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
THOP1P52888 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
THOP1P52888 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
THOP1P52888 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
THOP1P52888 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
THOP1P52888 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
THOP1P52888 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
THOP1P52888 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
THOP1P52888 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
THOP1P52888 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
THOP1P52888 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
THOP1P52888 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
THOP1P52888 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
THOP1P52888 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
THOP1P52888 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
THOP1P52888 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
THOP1P52888 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
THOP1P52888 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
THOP1P52888 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
THOP1P52888 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
THOP1P52888 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
THOP1P52888 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
THOP1P52888 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
THOP1P52888 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
THOP1P52888 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
THOP1P52888 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
THOP1P52888 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
THOP1P52888 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
THOP1P52888 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
THOP1P52888 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
THOP1P52888 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
THOP1P52888 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
THOP1P52888 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
THOP1P52888 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
THOP1P52888 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
THOP1P52888 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
THOP1P52888 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
THOP1P52888 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
THOP1P52888 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
THOP1P52888 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
THOP1P52888 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
THOP1P52888 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
THOP1P52888 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
THOP1P52888 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
THOP1P52888 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
THOP1P52888 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
THOP1P52888 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
THOP1P52888 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
THOP1P52888 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
THOP1P52888 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms