Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMARCA4P51532 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMARCA4P51532 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms