Protein–RNA interactions for Protein: P50395

GDI2, Rab GDP dissociation inhibitor beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDI2P50395 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GDI2P50395 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDI2P50395 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDI2P50395 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDI2P50395 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDI2P50395 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDI2P50395 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDI2P50395 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDI2P50395 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDI2P50395 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDI2P50395 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDI2P50395 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDI2P50395 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDI2P50395 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDI2P50395 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDI2P50395 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDI2P50395 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDI2P50395 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GDI2P50395 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDI2P50395 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDI2P50395 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDI2P50395 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDI2P50395 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDI2P50395 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDI2P50395 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDI2P50395 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDI2P50395 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDI2P50395 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDI2P50395 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDI2P50395 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDI2P50395 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDI2P50395 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDI2P50395 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDI2P50395 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDI2P50395 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDI2P50395 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDI2P50395 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GDI2P50395 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDI2P50395 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms