Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IDH3AP50213 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IDH3AP50213 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IDH3AP50213 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IDH3AP50213 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IDH3AP50213 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IDH3AP50213 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IDH3AP50213 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms