Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNNI2P48788 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TNNI2P48788 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms