Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIP4K2AP48426 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms