Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP2P42575 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP2P42575 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP2P42575 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP2P42575 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP2P42575 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP2P42575 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP2P42575 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP2P42575 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP2P42575 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP2P42575 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP2P42575 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP2P42575 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP2P42575 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP2P42575 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP2P42575 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP2P42575 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP2P42575 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP2P42575 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP2P42575 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP2P42575 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP2P42575 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP2P42575 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP2P42575 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP2P42575 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP2P42575 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP2P42575 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP2P42575 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP2P42575 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP2P42575 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP2P42575 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP2P42575 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP2P42575 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP2P42575 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP2P42575 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP2P42575 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP2P42575 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP2P42575 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP2P42575 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP2P42575 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP2P42575 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP2P42575 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP2P42575 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP2P42575 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP2P42575 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP2P42575 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP2P42575 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP2P42575 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP2P42575 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP2P42575 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP2P42575 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP2P42575 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP2P42575 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP2P42575 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASP2P42575 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms