Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOBEC1P41238 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOBEC1P41238 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms