Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK1P39086 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms