Protein–RNA interactions for Protein: P35408

PTGER4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER4P35408 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER4P35408 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms