Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
BMI1P35226 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
BMI1P35226 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BMI1P35226 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
BMI1P35226 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
BMI1P35226 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms