Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP6P35125 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP6P35125 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP6P35125 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP6P35125 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP6P35125 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP6P35125 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP6P35125 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP6P35125 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP6P35125 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP6P35125 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP6P35125 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP6P35125 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP6P35125 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP6P35125 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP6P35125 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP6P35125 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP6P35125 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP6P35125 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP6P35125 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP6P35125 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP6P35125 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP6P35125 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP6P35125 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP6P35125 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP6P35125 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP6P35125 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP6P35125 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP6P35125 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP6P35125 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP6P35125 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP6P35125 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP6P35125 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP6P35125 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP6P35125 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP6P35125 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP6P35125 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP6P35125 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP6P35125 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP6P35125 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP6P35125 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP6P35125 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP6P35125 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP6P35125 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP6P35125 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP6P35125 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP6P35125 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP6P35125 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP6P35125 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP6P35125 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP6P35125 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP6P35125 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP6P35125 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP6P35125 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP6P35125 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP6P35125 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP6P35125 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP6P35125 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP6P35125 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP6P35125 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP6P35125 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP6P35125 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP6P35125 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP6P35125 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP6P35125 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP6P35125 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP6P35125 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP6P35125 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP6P35125 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP6P35125 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP6P35125 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP6P35125 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP6P35125 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP6P35125 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP6P35125 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP6P35125 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP6P35125 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP6P35125 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP6P35125 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP6P35125 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP6P35125 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP6P35125 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP6P35125 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP6P35125 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP6P35125 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP6P35125 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP6P35125 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP6P35125 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP6P35125 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP6P35125 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP6P35125 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP6P35125 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP6P35125 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP6P35125 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP6P35125 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP6P35125 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP6P35125 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP6P35125 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP6P35125 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP6P35125 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms