Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTX2P32243 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTX2P32243 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTX2P32243 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTX2P32243 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTX2P32243 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTX2P32243 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTX2P32243 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTX2P32243 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTX2P32243 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTX2P32243 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTX2P32243 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTX2P32243 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
OTX2P32243 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTX2P32243 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTX2P32243 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTX2P32243 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
OTX2P32243 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTX2P32243 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTX2P32243 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTX2P32243 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTX2P32243 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
OTX2P32243 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTX2P32243 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OTX2P32243 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTX2P32243 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTX2P32243 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTX2P32243 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTX2P32243 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTX2P32243 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTX2P32243 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTX2P32243 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTX2P32243 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTX2P32243 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OTX2P32243 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OTX2P32243 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
OTX2P32243 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms