Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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HOXD10P28358 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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HOXD10P28358 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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HOXD10P28358 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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HOXD10P28358 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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HOXD10P28358 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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HOXD10P28358 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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