Protein–RNA interactions for Protein: P25024

CXCR1, C-X-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR1P25024 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCR1P25024 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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