Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5F1P24539 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms