Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALB2P22676 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALB2P22676 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALB2P22676 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALB2P22676 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALB2P22676 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALB2P22676 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALB2P22676 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALB2P22676 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALB2P22676 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALB2P22676 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALB2P22676 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CALB2P22676 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALB2P22676 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALB2P22676 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CALB2P22676 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALB2P22676 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALB2P22676 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALB2P22676 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALB2P22676 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALB2P22676 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CALB2P22676 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALB2P22676 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALB2P22676 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALB2P22676 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALB2P22676 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALB2P22676 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALB2P22676 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALB2P22676 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALB2P22676 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALB2P22676 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALB2P22676 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALB2P22676 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALB2P22676 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALB2P22676 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALB2P22676 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALB2P22676 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALB2P22676 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALB2P22676 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALB2P22676 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALB2P22676 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALB2P22676 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALB2P22676 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALB2P22676 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALB2P22676 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALB2P22676 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALB2P22676 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALB2P22676 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALB2P22676 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALB2P22676 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALB2P22676 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALB2P22676 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CALB2P22676 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALB2P22676 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALB2P22676 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALB2P22676 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALB2P22676 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALB2P22676 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALB2P22676 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALB2P22676 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALB2P22676 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALB2P22676 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALB2P22676 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALB2P22676 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALB2P22676 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALB2P22676 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALB2P22676 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALB2P22676 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALB2P22676 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALB2P22676 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALB2P22676 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALB2P22676 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALB2P22676 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALB2P22676 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALB2P22676 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CALB2P22676 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALB2P22676 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALB2P22676 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALB2P22676 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALB2P22676 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALB2P22676 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALB2P22676 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CALB2P22676 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALB2P22676 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALB2P22676 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALB2P22676 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALB2P22676 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALB2P22676 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALB2P22676 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALB2P22676 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALB2P22676 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALB2P22676 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALB2P22676 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALB2P22676 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CALB2P22676 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALB2P22676 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALB2P22676 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CALB2P22676 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALB2P22676 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALB2P22676 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms