Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPI1P17947 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPI1P17947 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPI1P17947 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPI1P17947 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPI1P17947 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPI1P17947 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPI1P17947 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPI1P17947 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPI1P17947 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPI1P17947 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPI1P17947 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPI1P17947 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPI1P17947 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPI1P17947 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPI1P17947 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPI1P17947 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPI1P17947 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPI1P17947 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPI1P17947 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPI1P17947 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPI1P17947 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPI1P17947 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPI1P17947 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPI1P17947 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPI1P17947 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPI1P17947 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPI1P17947 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPI1P17947 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPI1P17947 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPI1P17947 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPI1P17947 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPI1P17947 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPI1P17947 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPI1P17947 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPI1P17947 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPI1P17947 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPI1P17947 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPI1P17947 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPI1P17947 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPI1P17947 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPI1P17947 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPI1P17947 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPI1P17947 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms