Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFTRP13569 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFTRP13569 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFTRP13569 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFTRP13569 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFTRP13569 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFTRP13569 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFTRP13569 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CFTRP13569 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CFTRP13569 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFTRP13569 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CFTRP13569 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CFTRP13569 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CFTRP13569 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CFTRP13569 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CFTRP13569 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CFTRP13569 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CFTRP13569 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CFTRP13569 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CFTRP13569 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CFTRP13569 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CFTRP13569 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CFTRP13569 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CFTRP13569 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CFTRP13569 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFTRP13569 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CFTRP13569 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFTRP13569 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFTRP13569 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFTRP13569 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFTRP13569 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFTRP13569 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CFTRP13569 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFTRP13569 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFTRP13569 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CFTRP13569 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFTRP13569 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFTRP13569 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFTRP13569 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CFTRP13569 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFTRP13569 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFTRP13569 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFTRP13569 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFTRP13569 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFTRP13569 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFTRP13569 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFTRP13569 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFTRP13569 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFTRP13569 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFTRP13569 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFTRP13569 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFTRP13569 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFTRP13569 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFTRP13569 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CFTRP13569 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CFTRP13569 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFTRP13569 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFTRP13569 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFTRP13569 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFTRP13569 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CFTRP13569 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFTRP13569 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFTRP13569 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFTRP13569 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFTRP13569 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFTRP13569 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFTRP13569 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFTRP13569 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CFTRP13569 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFTRP13569 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFTRP13569 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFTRP13569 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CFTRP13569 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFTRP13569 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFTRP13569 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFTRP13569 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CFTRP13569 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFTRP13569 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFTRP13569 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFTRP13569 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFTRP13569 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFTRP13569 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFTRP13569 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFTRP13569 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFTRP13569 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFTRP13569 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CFTRP13569 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CFTRP13569 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFTRP13569 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CFTRP13569 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CFTRP13569 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CFTRP13569 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFTRP13569 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFTRP13569 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFTRP13569 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CFTRP13569 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFTRP13569 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFTRP13569 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFTRP13569 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CFTRP13569 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms