Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL2P13500 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL2P13500 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL2P13500 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL2P13500 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL2P13500 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL2P13500 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL2P13500 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL2P13500 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL2P13500 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL2P13500 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL2P13500 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL2P13500 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL2P13500 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL2P13500 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL2P13500 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL2P13500 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL2P13500 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL2P13500 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL2P13500 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL2P13500 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL2P13500 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL2P13500 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL2P13500 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL2P13500 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL2P13500 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCL2P13500 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCL2P13500 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCL2P13500 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCL2P13500 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCL2P13500 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCL2P13500 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCL2P13500 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCL2P13500 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCL2P13500 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCL2P13500 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCL2P13500 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCL2P13500 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCL2P13500 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCL2P13500 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCL2P13500 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCL2P13500 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCL2P13500 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCL2P13500 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCL2P13500 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCL2P13500 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCL2P13500 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCL2P13500 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCL2P13500 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CCL2P13500 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CCL2P13500 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CCL2P13500 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CCL2P13500 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCL2P13500 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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