Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUP10909 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUP10909 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUP10909 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUP10909 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUP10909 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUP10909 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUP10909 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUP10909 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUP10909 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUP10909 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUP10909 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUP10909 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUP10909 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUP10909 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUP10909 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUP10909 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUP10909 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUP10909 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUP10909 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUP10909 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUP10909 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUP10909 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUP10909 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUP10909 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUP10909 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms