Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHGAP10645 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHGAP10645 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHGAP10645 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHGAP10645 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHGAP10645 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHGAP10645 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHGAP10645 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHGAP10645 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHGAP10645 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHGAP10645 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CHGAP10645 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHGAP10645 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHGAP10645 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHGAP10645 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHGAP10645 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHGAP10645 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHGAP10645 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHGAP10645 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CHGAP10645 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHGAP10645 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHGAP10645 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHGAP10645 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHGAP10645 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHGAP10645 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHGAP10645 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHGAP10645 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHGAP10645 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHGAP10645 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHGAP10645 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHGAP10645 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHGAP10645 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHGAP10645 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHGAP10645 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHGAP10645 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHGAP10645 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHGAP10645 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHGAP10645 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHGAP10645 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHGAP10645 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHGAP10645 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CHGAP10645 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHGAP10645 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHGAP10645 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHGAP10645 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHGAP10645 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHGAP10645 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHGAP10645 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHGAP10645 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHGAP10645 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHGAP10645 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHGAP10645 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHGAP10645 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHGAP10645 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHGAP10645 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHGAP10645 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHGAP10645 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHGAP10645 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHGAP10645 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHGAP10645 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHGAP10645 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHGAP10645 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHGAP10645 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHGAP10645 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHGAP10645 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHGAP10645 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHGAP10645 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHGAP10645 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHGAP10645 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHGAP10645 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHGAP10645 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CHGAP10645 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHGAP10645 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHGAP10645 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHGAP10645 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHGAP10645 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHGAP10645 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHGAP10645 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHGAP10645 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHGAP10645 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHGAP10645 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHGAP10645 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHGAP10645 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHGAP10645 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHGAP10645 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHGAP10645 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHGAP10645 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHGAP10645 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHGAP10645 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHGAP10645 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHGAP10645 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHGAP10645 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHGAP10645 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHGAP10645 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHGAP10645 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHGAP10645 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHGAP10645 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CHGAP10645 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHGAP10645 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CHGAP10645 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms