Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFMP07197 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFMP07197 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFMP07197 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFMP07197 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFMP07197 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFMP07197 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFMP07197 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFMP07197 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEFMP07197 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NEFMP07197 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NEFMP07197 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NEFMP07197 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NEFMP07197 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NEFMP07197 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NEFMP07197 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFMP07197 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFMP07197 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFMP07197 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFMP07197 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFMP07197 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFMP07197 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFMP07197 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFMP07197 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFMP07197 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFMP07197 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFMP07197 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFMP07197 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFMP07197 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEFMP07197 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFMP07197 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFMP07197 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFMP07197 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFMP07197 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFMP07197 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFMP07197 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFMP07197 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFMP07197 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFMP07197 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFMP07197 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFMP07197 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFMP07197 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFMP07197 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFMP07197 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFMP07197 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFMP07197 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFMP07197 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFMP07197 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFMP07197 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEFMP07197 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFMP07197 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFMP07197 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFMP07197 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFMP07197 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFMP07197 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFMP07197 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFMP07197 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFMP07197 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFMP07197 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFMP07197 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFMP07197 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFMP07197 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFMP07197 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFMP07197 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFMP07197 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFMP07197 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFMP07197 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFMP07197 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFMP07197 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFMP07197 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFMP07197 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFMP07197 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFMP07197 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFMP07197 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFMP07197 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFMP07197 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFMP07197 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFMP07197 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFMP07197 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFMP07197 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFMP07197 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFMP07197 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFMP07197 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFMP07197 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEFMP07197 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFMP07197 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFMP07197 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFMP07197 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFMP07197 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFMP07197 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFMP07197 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFMP07197 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFMP07197 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFMP07197 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFMP07197 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFMP07197 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFMP07197 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFMP07197 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFMP07197 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEFMP07197 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms