Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGAVP06756 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms