Protein–RNA interactions for Protein: P04436

T-cell receptor alpha chain V region HPB-MLT (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04436 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P04436 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P04436 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04436 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P04436 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04436 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04436 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04436 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04436 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04436 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04436 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04436 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04436 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04436 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04436 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04436 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04436 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04436 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04436 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04436 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04436 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P04436 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P04436 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04436 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04436 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04436 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04436 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04436 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04436 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04436 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04436 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04436 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04436 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04436 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04436 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04436 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04436 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04436 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04436 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04436 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04436 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04436 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04436 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P04436 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P04436 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04436 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P04436 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms