Protein–RNA interactions for Protein: P04216

THY1, Thy-1 membrane glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THY1P04216 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
THY1P04216 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THY1P04216 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THY1P04216 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THY1P04216 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THY1P04216 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THY1P04216 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THY1P04216 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THY1P04216 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THY1P04216 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THY1P04216 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THY1P04216 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THY1P04216 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THY1P04216 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THY1P04216 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THY1P04216 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THY1P04216 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THY1P04216 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THY1P04216 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THY1P04216 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THY1P04216 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THY1P04216 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THY1P04216 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THY1P04216 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THY1P04216 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THY1P04216 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
THY1P04216 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THY1P04216 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THY1P04216 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THY1P04216 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THY1P04216 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THY1P04216 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THY1P04216 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THY1P04216 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
THY1P04216 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
THY1P04216 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
THY1P04216 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THY1P04216 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THY1P04216 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
THY1P04216 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
THY1P04216 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THY1P04216 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THY1P04216 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THY1P04216 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THY1P04216 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THY1P04216 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THY1P04216 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THY1P04216 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
THY1P04216 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THY1P04216 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THY1P04216 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
THY1P04216 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms