Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C6orf47O95873 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms