Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR1AO95602 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR1AO95602 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms