Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms