Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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TIMM17BO60830 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
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TIMM17BO60830 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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TIMM17BO60830 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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TIMM17BO60830 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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TIMM17BO60830 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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TIMM17BO60830 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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TIMM17BO60830 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TIMM17BO60830 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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