Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPLO60437 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPLO60437 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPLO60437 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPLO60437 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPLO60437 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPLO60437 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PPLO60437 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPLO60437 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PPLO60437 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPLO60437 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPLO60437 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPLO60437 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PPLO60437 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPLO60437 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PPLO60437 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PPLO60437 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PPLO60437 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPLO60437 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPLO60437 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPLO60437 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPLO60437 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPLO60437 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPLO60437 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPLO60437 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PPLO60437 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPLO60437 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PPLO60437 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPLO60437 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPLO60437 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PPLO60437 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPLO60437 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPLO60437 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPLO60437 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPLO60437 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPLO60437 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPLO60437 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPLO60437 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPLO60437 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPLO60437 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PPLO60437 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPLO60437 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPLO60437 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PPLO60437 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPLO60437 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPLO60437 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PPLO60437 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPLO60437 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PPLO60437 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPLO60437 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPLO60437 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPLO60437 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPLO60437 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPLO60437 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPLO60437 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPLO60437 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPLO60437 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPLO60437 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPLO60437 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPLO60437 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPLO60437 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPLO60437 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPLO60437 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PPLO60437 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PPLO60437 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPLO60437 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPLO60437 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPLO60437 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPLO60437 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPLO60437 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPLO60437 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPLO60437 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPLO60437 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPLO60437 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPLO60437 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPLO60437 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PPLO60437 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPLO60437 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPLO60437 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPLO60437 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPLO60437 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PPLO60437 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPLO60437 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPLO60437 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPLO60437 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPLO60437 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPLO60437 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPLO60437 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPLO60437 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPLO60437 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPLO60437 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPLO60437 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPLO60437 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPLO60437 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPLO60437 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPLO60437 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPLO60437 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPLO60437 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPLO60437 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PPLO60437 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms