Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LRRTM2O43300 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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