Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF1O43189 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF1O43189 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF1O43189 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF1O43189 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF1O43189 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF1O43189 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF1O43189 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF1O43189 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF1O43189 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF1O43189 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PHF1O43189 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF1O43189 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF1O43189 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF1O43189 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF1O43189 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF1O43189 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF1O43189 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF1O43189 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF1O43189 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF1O43189 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF1O43189 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF1O43189 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF1O43189 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF1O43189 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF1O43189 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF1O43189 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF1O43189 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF1O43189 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF1O43189 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF1O43189 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF1O43189 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF1O43189 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF1O43189 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF1O43189 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF1O43189 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF1O43189 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF1O43189 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF1O43189 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF1O43189 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF1O43189 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF1O43189 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF1O43189 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF1O43189 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF1O43189 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF1O43189 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF1O43189 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF1O43189 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF1O43189 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF1O43189 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF1O43189 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PHF1O43189 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF1O43189 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF1O43189 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PHF1O43189 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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