Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LAMA5O15230 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms