Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms