Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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