Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC4A6NH21 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms