Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL20Q9Y2M5 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL20Q9Y2M5 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL20Q9Y2M5 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL20Q9Y2M5 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL20Q9Y2M5 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL20Q9Y2M5 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL20Q9Y2M5 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL20Q9Y2M5 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL20Q9Y2M5 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL20Q9Y2M5 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL20Q9Y2M5 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL20Q9Y2M5 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL20Q9Y2M5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL20Q9Y2M5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL20Q9Y2M5 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL20Q9Y2M5 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL20Q9Y2M5 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL20Q9Y2M5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL20Q9Y2M5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL20Q9Y2M5 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL20Q9Y2M5 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL20Q9Y2M5 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL20Q9Y2M5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL20Q9Y2M5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL20Q9Y2M5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL20Q9Y2M5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL20Q9Y2M5 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL20Q9Y2M5 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL20Q9Y2M5 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL20Q9Y2M5 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL20Q9Y2M5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL20Q9Y2M5 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL20Q9Y2M5 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL20Q9Y2M5 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL20Q9Y2M5 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL20Q9Y2M5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL20Q9Y2M5 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms