Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FBXL4Q9UKA2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms