Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RIMS3Q9UJD0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms