Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTNNA3Q9UI47 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms