Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN11AQ9UI33 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN11AQ9UI33 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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