Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLIP2Q9UDT6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLIP2Q9UDT6 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms