Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HIGD1BQ9P298 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms