Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
USP36Q9P275 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
USP36Q9P275 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms