Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms