Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf109Q9NX04 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms