Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRT82Q9NSB4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms