Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms